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科學網(wǎng):研究揭示全球金黃色葡萄球菌耐藥基因進化及傳播機制
【發(fā)布日期: 2023-12-09】 【來源: 】 【作者:】 【編輯:陳勝偉】 【點擊量:

近日,浙江農(nóng)林大學食品與健康學院劉興泉教授團隊在《危險材料雜志》在線發(fā)表了題為《過去100多年來全球金黃色葡萄球菌的耐藥性縱向趨勢監(jiān)測及其進化和傳播機制解析》的學術(shù)論文。該論文探究了100多年來全球食源性致病菌—金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)耐藥基因的進化的驅(qū)動因素及傳播機制。

金黃色葡萄球菌中的耐藥基因數(shù)量隨時間、抗生素消耗和人類發(fā)展指數(shù)增加顯示出顯著的上升趨勢。(課題組供圖)

論文通訊作者劉興泉告訴《中國科學報》,在對過去100多年來全球金黃色葡萄球菌的耐藥性縱向趨勢監(jiān)測及其進化和傳播機制解析的基礎(chǔ)上,研究團隊利用了一種機器學習算法成功預(yù)測了全球陸地范圍內(nèi)金黃色葡萄球菌的抗生素耐藥風險,準確率超過70%。相關(guān)研究結(jié)果,對其他科研和醫(yī)療衛(wèi)生相關(guān)人員制定與金黃色葡萄球菌相關(guān)的感染治療策略也具有重要意義。

金黃色葡萄球菌是一種常見的食源性致病菌,經(jīng)常在人類皮膚、食品、污水等檢測到。近年來,全球金黃色葡萄球菌感染的發(fā)病率顯著上升,已成為僅次于大腸桿菌的第二大常見細菌性致病菌。在美國,金黃色葡萄球菌毒素中毒約占細菌性食物中毒案例的33%,在加拿大超過45%,在中國,金黃色葡萄球菌引起的感染也一直高發(fā)。抗生素治療金黃色葡萄球菌感染,是常用的醫(yī)療手段,但由于抗生素廣泛使用,導致大量致病微生物出現(xiàn)抗生素耐藥性。金黃色葡萄球菌中檢測到的廣泛耐藥性,對國際公共衛(wèi)生構(gòu)成了嚴峻挑戰(zhàn),也使得全球患者和衛(wèi)生系統(tǒng)財政負擔加重,同時致使金黃色葡萄球菌感染病患的死亡率上升。

劉興泉團隊的研究,縱向監(jiān)測了1884年至2022年間分離的586株金黃色葡萄球菌的抗生素耐藥性基因(ARGs)的全球趨勢:金黃色葡萄球菌中的耐藥基因隨時間增加顯示出顯著的上升趨勢,平均每個基因組中耐藥基因數(shù)量從1970年前的19.14增加到2010年后的24.88。此外,2000年后分離出的金黃色葡萄球菌菌株耐藥基因數(shù)量(24.65)顯著高于2000年前的菌株(20.61)。金黃色葡萄球菌菌株中的耐藥基因數(shù)量,與人類發(fā)展指數(shù)(HDI)之間存在顯著正相關(guān)性。相關(guān)研究發(fā)現(xiàn)表明,社會經(jīng)濟狀況在抗生素抗性方面的影響很大,值得進一步研究,全球抗生素消費的增加,顯著增加了金黃色葡萄球菌中的耐藥基因。可移動遺傳元件在金黃色葡萄球菌菌株的抗生素耐藥基因轉(zhuǎn)移中起著至關(guān)重要的作用。轉(zhuǎn)座子tnpA是耐藥基因的重要驅(qū)動者,接合轉(zhuǎn)座子Tn916與四環(huán)素和紅霉素類抗生素相關(guān)基因的轉(zhuǎn)移有關(guān)。

此外,課題組成員檢測了所有金黃色葡萄球菌完整基因組中耐藥基因附近(上下游5000 bp)是否存在可移動遺傳元件。在所有耐藥基因中檢測到2924個相鄰的可移動遺傳元件(在15.33%的耐藥基因附近檢出),并且有243個質(zhì)粒和579個染色體中攜帶了耐藥基因,表明質(zhì)粒是耐藥基因的重要貢獻者。結(jié)構(gòu)方程模型結(jié)果顯示,人類發(fā)展指數(shù)(HDI)與抗生素消費量的增加之間存在顯著相關(guān)性,這也驅(qū)動了金黃色葡萄球菌菌株的抗生素耐藥性上升。

相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2023.133136

https://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/513910.shtm 科學網(wǎng):2023.12.9

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